与二级市场定增逐步趋冷相反，新三板定向增发近来呈现不断活跃趋势。清科数据显示，截至目前，除去6家已转板企业，新三板挂牌的116家企业中，有26家已实施定向增发（不含已转板企业）。新三板成立以来，定增企业数量连年递增，特别是2009年以来，新三板企业定增规模迅速扩大，且大部分企业定增时都有VC/PE（风险投资/私募股权投资）机构跻身其中，仅2012年就已有8家新三板企业发布定增公告，其中背后显现出7家VC/PE机构。
在已实施定增的26家挂牌企业中，20家引入了VC/PE投资，涉及VC/PE机构27家，投资总额达3.57亿元人民币。其中表现最为活跃的当数东方汇富旗下子公司天一投资，参与了4家企业的定向增发。投资新三板的VC/PE机构不乏复星创富、中科招商、天堂硅谷、东方汇富、启迪创投等知名VC/PE机构。此外，德同资本、卡贝基金资本两家外资PE机构也涉足新三板。
清科研究中心分析师张琦认为，新三板企业目前的价值尚未得到完全开发，大部分企业市盈率分布在10~30倍之间，平均市盈率在20倍左右。目前中小板、创业板的市盈率仍在30倍上下，相比之下，VC/PE机构注资新三板企业的成本较低，日后退出可带来丰厚回报。
行业方面，VC/PE机构参与定增的新三板企业主要分布在IT、机械制造、电子及光电设备、清洁技术、生物技术/医疗健康、互联网六大行业。其中，IT行业最受青睐，9家企业获得投资，机械制造业有5家企业获得投资位居第二。
2009年和2010年，北陆药业、世纪瑞尔等三板企业先后通过IPO转板深圳中小板和创业板，北京科技风投、盈富泰克、国投高科、启迪创投几家机构为此收获颇丰，其中，投资于北陆药业的北京科技风投账面回报水平高达19.49倍。
对于新三板未来的扩容改革，张琦认为，VC/PE机构届时将获得更多投资标的及资本退出渠道。另外，目前已有多家新三板企业排队等候上市，一旦转板成功，企业价值将被重估，VC/PE机构还将获得被投企业转板上市的价差收益。
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